Si bien es posible, desde un punto de vista purista no va a ser práctico.
He estudiado las construcciones de ordenadores de Minecraft y son aproximadamente iguales a los ordenadores de hace 30 años en métrica. El problema es que en Minecraft todo se construye manualmente, por lo que se comprueba cada circuito lógico y se tarda unos minutos. Un ordenador moderno utiliza los avances en la miniaturización para escalar los procesadores, la memoria y el almacenamiento.
El ordenador que miré como el último tenía unos pocos kilobytes de espacio. Minecraft en mi ordenador ocupa unos cuantos gigas de espacio, lo cual es varios órdenes de magnitud mayor.
Luego está Java, oh la pieza que es el lenguaje Java. Supongo que querrás programar tu versión de minecraft en Java, porque la versión de Java puede funcionar bien en linux que es un sistema Operativo mucho más ligero que requiere menos recursos del sistema, por lo que hay que construir menos.
Vas a tener que codificar a mano cada una de estas cosas y en este orden para conseguir un equipo funcional que ejecute Minecraft tal y como lo ejecutas en tu ordenador;
- Conjunto de instrucciones, el código para ejecutar el procesador de forma eficiente
- Sistema Operativo, se prefiere Linux así que espero que estés estudiado en C.
- Compilador de Java (convierte java en código máquina que se puede ejecutar dentro de JRE)
- Entorno de ejecución de Java (la parte más exigente en recursos de esta lista.)
- Minecraft.
Así que vas a hacer todo eso y sólo puedes empezar después de construir un ordenador capaz de ello.
Se me ocurren proyectos de programación más interesantes, y proyectos de Minecraft más interesantes ahora que lo pienso. Si te gusta la programación y el minecraft te sugiero Computercraft que te permite programar ordenadores dentro de Minecraft en Lua y pueden hacer una cantidad importante de tareas.