¿Puedo programar una aplicación iOS en Eclipse para C++?

Básicamente la respuesta es no, pero es difícil dar un consejo específico sin saber por qué no quieres usar XCode. Si por "Eclipse para C++" te refieres a través de Eclipse con CDT, entiende que CDT no sabe nada de iOS.

No conozco ningún plugin de Eclipse para hacer desarrollo nativo en iOS, aunque de una búsqueda superficial en google …