Como ocurre con todas las preguntas en economía, la respuesta a esta pregunta es: depende.
Si el investigador necesita evaluar el impacto, a nivel global, de un shock externo (por ejemplo, que los precios del petróleo caigan un 50% en menos de un año) en la economía de México (mi país), necesitaría un software de análisis numérico. Cuando era estudiante, primero aprendí a modelar modelos de equilibrio general en GAMS (General Algebraic Modeling System). Luego aprendí a modelarlos en Octave, ya que es de código abierto (no podría trabajar sin GAMS si mis futuros empleadores no están dispuestos a pagar por GAMS o Matlab).
Por otro lado, si la investigadora necesita pronosticar una serie de tiempo’ valor para el siguiente trimestre (por ejemplo, el consumo diario de electricidad en la Ciudad de México en julio de 2018), entonces necesitaría un paquete de software estadístico. De nuevo, como estudiante aprendí primero a construir modelos de previsión con Stata, pero lo dejé y aprendí a programar esos modelos en R, ya que es de código abierto.
Los dos ejemplos anteriores son suficientes para mostrar que diferentes herramientas sirven para diferentes propósitos. Claro que se puede ejecutar un modelo de Equilibrio General Dinámico Estocástico (DSGE) en R, al igual que se puede ejecutar un modelo Holt-Winters en Octave. Esto se debe a que cada herramienta está ampliando constantemente sus capacidades.