Desde el punto de vista laboral, no creo que haya una opción mejor que CS. Mi opinión sobre la ingeniería de sistemas es que es una disciplina que no se puede enseñar eficazmente en el nivel universitario. Es como la gestión; sí, puedes obtener una licenciatura en gestión, pero ¿quién contrataría a un recién graduado universitario como gerente? Ni siquiera podrías conseguir un trabajo como gerente de un restaurante de comida rápida sin años de experiencia (claro, como asistente de gerente tal vez después de un año, pero dan títulos de asistente de gerente como los bancos dan títulos de vicepresidente).
La clave con la ingeniería de sistemas es que se encuentra en la intersección de múltiples campos e implica problemas complejos del mundo real. No tienes suficiente contexto para eso. Obtén el grado en CS (o cualquier disciplina STEM que te guste), ve a trabajar por un tiempo, trabaja en sistemas complejos e integrados cuando puedas, y considera un grado de posgrado en ingeniería de sistemas.
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¡Buena suerte!