Sí, por varias razones.
En primer lugar, las unidades internas tienden a transferir datos hacia y desde su CPU más rápido porque generalmente tiene una velocidad de bus más rápida. Ben Drury lo explica muy bien.
Además, mi ordenador tarda bastante más en arrancar con discos externos conectados que sin ellos. La naturaleza de la bestia a veces. (No, no estoy arrancando desde esos discos. Simplemente parece que mi ordenador tiene que hacer inventario o algo así antes de dirigir su atención a mi teclado.)
Dicho esto, tengo 6 discos duros externos conectados a mi Mac Mini, con un total de 27 Tb. Son discos MUY rápidos. Leen y escriben más rápido que mi disco interno. Copian de un disco a otro más rápido que mi disco interno. Creo -aunque no estoy muy seguro- que puedo copiar 10 Gb de una unidad a otra sin que esos datos tengan que pasar por el ordenador, sólo de una unidad a otra a través del hub USB común, porque, cuando hago eso, hay muy poco impacto en el rendimiento cuando luego voy a hacer otra cosa.
Las unidades externas para mis datos también facilitan mucho las copias de seguridad incrementales: Copio todo de la unidad 01 a la unidad 02 mediante una copia de seguridad incremental. No hay nada extra en la copia de seguridad.
Y deja mi unidad principal bastante abierta para los archivos de intercambio y la sala de operaciones.
Pero, como se ha dicho, las unidades externas pueden tener un impacto adverso en aspectos de su velocidad de computación.