El reloj de un ordenador se basa en un circuito conocido como oscilador, que hace que un nivel de tensión cambie de estado a una velocidad muy precisa. La señal (cambio de voltaje) se divide y subdivide a su vez por otros circuitos digitales (divisores y contadores, por ejemplo) compuestos por puertas lógicas hasta que se alcanza la frecuencia deseada y esa señal se convierte en el reloj del ordenador.
Una analogía muy aproximada sería la de los dientes de un engranaje empujando los dientes de otros engranajes para cambiar la velocidad de giro de un eje. Los circuitos digitales suelen cambiar de estado en cada ciclo de reloj.
La señal de reloj se envía a otros circuitos: el procesador, la memoria, los búferes, etc. En un ordenador moderno, la mayoría de estos circuitos digitales clásicos se combinan juntos en los (enormes) circuitos integrados que conforman la familia de chips de los ordenadores, pero hubo un tiempo en que las puertas lógicas individuales se combinaban para formar unidades aritméticas lógicas, búferes, contadores, etc.
Como se ha mencionado en otras respuestas, hay otros circuitos de sincronización, el más notable es el reloj de tiempo real, en un ordenador. Pero la señal «clk» es el latido de todo el sistema.
Si todo esto es algo esotérico, sí. . .tenía que empezar por algún sitio, y como quería una respuesta que (al menos algunas) personas leyeran-entonces no sería la electrónica digital básica que define las puertas y los circuitos digitales comunes que he mencionado antes.