Para que la lista sea extensa, depende mucho del enfoque que tenga como ingeniero. Por ejemplo, mi trabajo es de dinámica de fluidos experimental por lo que he aprendido mucho software que me ayuda a realizar experimentos, tomar datos y analizarlos mientras que tengo menos experiencia con programas relacionados con CFD. Mi mejor respuesta es la siguiente:
Software general
1) Familiaridad con diferentes sistemas operativos (Windows, Mac, Linus, Unix, etc.)
2) Microsoft Office y procesamiento de documentos (Word, Excel, Powerpoint) ya que como ingenieros tenemos que ser capaces de comunicar nuestro trabajo a los demás.
3) Matlab es una herramienta de programación común utilizada para los ingenieros, aunque C++ y Fortran también tiene sus aplicaciones. Por ejemplo, sé que los códigos CFD utilizan mucho Fortran ya que compila el código y ejecuta grandes conjuntos de datos mucho más rápido.
4) Software CAD. Los más comunes son Solidworks, Unigraphics, ProEngineer, Catia, AutoCad, y hay muchos otros. Si usted crea cosas, el CAD es una necesidad. Diferentes empresas tienen preferencias en el software CAD sin embargo la compatibilidad de archivos está mejorando continuamente.
Experimentos
5) National Instruments LabVIEW es un estándar para los experimentalistas en estos días. Permite una fácil interconexión entre el hardware y el software para que pueda adquirir datos, controlar experimentos y procesar/analizar datos. Es una programación basada en gráficos (que me parece muy intuitiva y fácil de aprender).
Computaciones
6) FLUENT, OpenFOAM, ANSYS, etc. Dependiendo de lo que estés trabajando y si tienes acceso a software comercial. Aquí hay una buena lista de software para FEA Lista de paquetes de software de elementos finitos
Estudiante de posgrado
7) Latex. Este es un software de procesamiento de documentos de código abierto que tiene una curva de aprendizaje empinada, pero una vez aprendido, hace que la escritura de una tesis o disertación sea mucho más fácil y de mayor calidad. LaTeX - Un sistema de preparación de documentos o LaTeX
Sin duda aprenderás muchos paquetes de software especializados a lo largo de tu carrera, sobre todo porque el software está inundando todos los aspectos de nuestras vidas y trabajo en estos días. Por ejemplo, yo también he aprendido software de edición de vídeo, software especializado para procesar datos adquiridos con una herramienta de medición especializada (Davis - para procesar datos PIV), software de programación web (html y CSS), y mucho más.
Deja que tu educación y tu carrera te guíen, pero mantén siempre la mente abierta para aprender nuevos programas, ¡te sorprenderás cuando ciertas habilidades te resulten útiles!