Description

BioBlender es un paquete de software creado en el software de modelado 3D de código abierto Blender.

La biología funciona a nanoescala, con objetos invisibles al ojo humano. Con BioBlender es posible mostrar algunos de los personajes que pueblan nuestras células, según los datos científicos y el estándar más alto de manipulación 3D. Científicos de todo el mundo estudian proteínas a nivel atómico y depositan información en el repositorio público Protein Data Bank, donde cada molécula se describe como la lista de sus átomos y sus coordenadas 3D ....

Con BioBlender, los usuarios pueden manejar proteínas en el espacio 3D, mostrando su superficie de forma fotorrealista y elaborando movimientos de proteínas sobre la base de conformaciones conocidas.

Los archivos PDB se pueden cargar desde un directorio definido por el usuario o se pueden descargar directamente desde el sitio de PDB (insertando el código de PDB). La proteína se muestra en 3D (como átomos o superficie molecular) y el usuario puede calcular y visualizar sus propiedades de superficie, el potencial lipofílico molecular y el potencial electrostático. Para el movimiento de proteínas, BioBlender calcula intermedios entre dos conformaciones utilizando Blender Game Engine. El programa proporciona como salida tanto los archivos PDB intermedios como las imágenes renderizadas como una película.

BioBlender es una implementación de Blender, un programa de código abierto, de distribución gratuita, multiplataforma, interoperable y compatible de animación 3D, efectos visuales y videojuegos.

La combinación de gráficos de computadora en 3D, motor de juegos y programas científicos, hacen de BioBlender un instrumento completo para elaborar el movimiento de proteínas y mostrar sus características de superficie utilizando un código visual basado en efectos especiales de texturado y partículas. De esta manera, es posible mostrar las propiedades físicas y químicas de una molécula en movimiento.

BioBlender es el resultado de una colaboración, impulsada por el grupo SciVis en el CNR en Pisa ( Italia), entre científicos de diferentes disciplinas (biología, química, física, ciencias de la computación) y

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