¿Puede freenas funcionar como una máquina virtual en un hyperv de Windows?
Sí, podrías. Pero que lo hagas depende de cuál sea tu objetivo.
Como mencionan las otras respuestas, el rendimiento del NAS probablemente se verá afectado. Pero esto supone que no estás utilizando un hardware de mayor rendimiento, y que la velocidad de la red y del disco es …